Спустя три года после конфликта в Черноруси, изображенного в оригинальной Arma 2, новый конфликт назрел в области Зеленого моря, и силы коалиции во главе с армией США посылают в Такистан, чтобы быстро восстановить мир и предотвратить дальнейшие жертвы среди гражданского населения.